環保稅體系設計新方案已由財政部財政科學研究所上報財政部，在該方案中，碳稅不再被視為環保稅之下的“二氧化碳”稅目，而是獨立稅種。
財科所副所長蘇明透露，財科所最新上報財政部的課題建議，碳稅作為單獨稅種立法并開征，可在“十二五”中后期開征，征稅對象包括煤炭、原油、天然氣等溫室氣體排放大戶。“環保稅、碳稅兩稅齊征并不會影響稅率，因而不會導致企業稅負過重”。未來碳稅稅率制定要綜合二氧化碳排放量、行業利潤空間等因素。
上述課題建議，碳稅稅源留在中央。“根據財科所建立的模型，從每噸二氧化碳10元的較低稅率起步，稅率逐步提高”。
在碳稅的稅收優惠方面，蘇明表示，根據實際情況，可在不同時期對受影響較大的能源密集型行業給予一定程度的減稅；可對積極采用技術減排和回收二氧化碳并達到一定標準的企業，給予減免稅優惠。
